La restauració de l'antic Carmen Flores va ser una operació llarga i complexa, però va significar la recuperació d'una nau històrica practicant oficis que estaven en perill de perdre's i aprenent tècniques específiques de construcció naval en fusta.
Després de 80 anys (el Carmen Flores va ser construït l’any 1918) durant els quals va patir transformacions que el feien irreconeixible com a pailebot, s'havia de recuperar l'essència amb la qual havia nascut a les platges de Torrevieja.
Varen ser quatre anys de treballs, -des del 16 de març de 1997, quan el Sayremar I (nom que tenia en aquell moment el vaixell) arribà a Barcelona, fins l’abril de 2001, quan va fer el seu primer viatge ja com a pailebot Santa Eulàlia-, gràcies als quals el museu ha recuperat un patrimoni que estava en seriós perill de desaparició.
